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COSMOtherm贏得SAMPL6挑戰(zhàn)賽
COSMOtherm在SAMPL6挑戰(zhàn)賽中,預(yù)測(cè)一系列藥物類分子的辛醇-水分配系數(shù)(logP),被證明所有參賽方法中最準(zhǔn)確的方法。原始數(shù)據(jù)和結(jié)果請(qǐng)參考鏈接。
(2019年4月)
COSMOtherm在SAMPL6挑戰(zhàn)賽中,預(yù)測(cè)一系列藥物類分子的辛醇-水分配系數(shù)(logP),被證明所有參賽方法中最準(zhǔn)確的方法。原始數(shù)據(jù)和結(jié)果請(qǐng)參考鏈接。
本次挑戰(zhàn)賽是預(yù)測(cè)11種蛋白激酶抑制劑片段在水相和辛醇相中分配情況。因?yàn)榛钚晕镔|(zhì)在生物體中的分布與化合物分子的上述性質(zhì)有強(qiáng)烈的相關(guān)性,所以對(duì)新藥開發(fā)至關(guān)重要。上述化合物的性質(zhì)組織者提前通過實(shí)驗(yàn)得到結(jié)果,而參賽者是純粹用自己的計(jì)算模擬方法得到的結(jié)果,以便評(píng)估各自預(yù)測(cè)方法的真實(shí)預(yù)測(cè)性。91個(gè)參賽者采用幾乎所有計(jì)算模擬方法,包括從分子動(dòng)力學(xué)到深度學(xué)習(xí),進(jìn)行理論預(yù)測(cè)。COSMOtherm基于FINE系列參數(shù)計(jì)算得到最佳結(jié)果(RMSE-均方根誤差和MAE-平均絕對(duì)誤差都最低)?;?strong>COSMOquick的預(yù)測(cè)使用基于機(jī)器學(xué)習(xí)的經(jīng)驗(yàn)修正項(xiàng),在較低水平的COSMOtherm計(jì)算之上排在第三位。本次SAMPL6挑戰(zhàn)賽結(jié)果支持COSMOtherm是目前理論計(jì)算預(yù)測(cè)溶解自由能最準(zhǔn)確的方法的觀點(diǎn)。

COSMOtherm,COSMOquick
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