Materials Studio 2021新版本發(fā)布！
Materials Studio 2021增加一系列面向產(chǎn)品研發(fā)的新功能，進(jìn)一步擴(kuò)展了在熱門研究領(lǐng)域的應(yīng)用能力，包括在新功能材料和能源材料方面。
Materials Studio 2021新版本發(fā)布！
Materials Studio 2021增加一系列面向產(chǎn)品研發(fā)的新功能，進(jìn)一步擴(kuò)展了在熱門研究領(lǐng)域的應(yīng)用能力，包括在新功能材料和能源材料方面。
Materials Studio新增功能
• 新模塊FlexTS，F(xiàn)lexTS為DMol3和DFTB+提供了在勢能面上找到固定的任務(wù)功能，使計(jì)算反應(yīng)路徑和與化學(xué)反應(yīng)相關(guān)的能壘成為可能。
• Materials Studio Collection基于Pipeline Pilot新增的系列protocols，采用PhaseField計(jì)算硬質(zhì)材料的硬化和晶粒生長。用戶可在Materials Studio的Pipeline Pilot Connector中訪問Metal Alloy文件夾，并使用上述protocols。Materials Studio提供兩個(gè)相關(guān)案例，介紹上述protocols使用方法。
• Forcite和Mesocite計(jì)算中可使用GPU加速，同時(shí)可提交GPU任務(wù)到任何支持的排隊(duì)系統(tǒng)中。
Materials Studio各模塊增強(qiáng)功能
Cantera
• Cantera升級(jí)到2.4.0版本，Python升級(jí)到3.8.1。
CASTEP
• 在CASTEP的彈性常數(shù)計(jì)算結(jié)果中加入了Niu等（2019）的材料斷裂韌度估算經(jīng)驗(yàn)?zāi)Ｐ?，預(yù)測脆性材料性質(zhì)。
• CASTEP現(xiàn)可計(jì)算孤立分子的溶劑化能。
• 在CASTEP中實(shí)現(xiàn)了二次諧波產(chǎn)生系數(shù)張量的計(jì)算，有助于開發(fā)非線性光學(xué)材料。
• CASTEP中增加了自發(fā)極化的Berry phase計(jì)算方法。
• CASTEP中的自旋軌道耦合計(jì)算現(xiàn)已擴(kuò)展到：
(1) 動(dòng)態(tài)產(chǎn)生的norm-conserving贗勢。
(2) 光學(xué)性質(zhì)計(jì)算。
(3) 支持使用非局域交換關(guān)聯(lián)泛函。
(4) 在Materials Visualizer中設(shè)置非共線自旋構(gòu)型。
COMPASS
• COMPASSIII支持與鋰離子電池相關(guān)的硼化物，例如雙（草酸）硼酸鹽、二氟（草酸）硼酸鹽和吡啶三氟化硼的計(jì)算。
• COMPASS (2.8)與cvff_nocross_nomorse力場遷到FORCEFIELDS-LEGACY文件夾。這個(gè)文件夾中的力場可以從Forcite Forcefield管理器對(duì)話框中導(dǎo)入。COMPASSII已被刪除。使用COMPASS或COMPASSII的項(xiàng)目會(huì)自動(dòng)定向到當(dāng)前版本的COMPASSIII。
DFTB+
• 新的FlexTS功能通過新的Minimum Energy Path任務(wù)項(xiàng)添加到DFTB+中。FlexTS是用于構(gòu)建最小能量路徑的工具，包括NEB方法。
DMol3
• 通過新的Minimum Energy Path任務(wù)項(xiàng)在DMol3中增加FlexTS功能。FlexTS是用于構(gòu)建最小能量路徑的工具，包括NEB方法。
• 在DMol3的彈性常數(shù)計(jì)算結(jié)果中加入了Niu等（2019）的脆性材料斷裂韌度估計(jì)經(jīng)驗(yàn)?zāi)Ｐ汀?/span>
• DMol3分子動(dòng)力學(xué)現(xiàn)可以使用XSD文件的當(dāng)前速度作為初始速度。
Forcite
• 在Materials Studio forcefields中添加了對(duì)Urey-Bradley相互作用和CHARMM反轉(zhuǎn)的支持。
• 為Materials Studio forcefields添加了新的van der Waals函數(shù)形式LJ_12_6_14，允許為1-4相互作用指定不同的R0和D0值。
• 可以從Forcite力場管理器導(dǎo)入增強(qiáng)版的cvff力場--cvff_aug。
GULP
• GULP升級(jí)到6.0版本。周期體系的剛性分子模型支持幾何優(yōu)化、性質(zhì)和聲子計(jì)算。
• 新增ReaxFF庫--“ReaxFF SEI”。它基于Hossain等的研究報(bào)道（J. Chem. Phys., 152, 184301（2020）），旨在描述鋰電池電解液和固體電解質(zhì)界面。
ONETEP
• 在ONETEP中實(shí)現(xiàn)了一系列的雜化泛函。
• ONETEP隱式溶劑計(jì)算擴(kuò)展到Poisson-Boltzmann方法，把電解質(zhì)離子作為點(diǎn)電荷，忽略它們之間的相互作用，但影響溶質(zhì)的篩選。
• ONETEP模塊已更新為使用該代碼的學(xué)術(shù)版本6.1.1。
Materials Visualizer的增強(qiáng)
• 所有的.msi格式的示例結(jié)構(gòu)都已轉(zhuǎn)換為.xsd格式。
• 通過MSC將研究表格和軌跡文件作為單個(gè)壓縮文件從Materials Studio傳輸?shù)絇ipeline Pilot。
• 所有基于forcefield的模塊添加了一個(gè)ReportAutomaticTerms設(shè)置，用于打開或關(guān)閉使用自動(dòng)詳細(xì)信息報(bào)告功能。
Materials Script的增強(qiáng)
MaterialsScript支持在Forcite和Mesocite計(jì)算中使用GPU加速。
MaterialsScript使用的Perl版本已在MaterialsStudio 2021中更新。Perl的更新版本提供了各種新特性，但也對(duì)Perl腳本和模塊的語法提出了額外的要求。這些附加要求適用于所有新的MaterialsScript腳本。
在Materials Studio客戶端運(yùn)行的MaterialsScript使用Perl5.26.1版本。
• 有關(guān)Materials Studio 2021中Perl更改的更多信息，詳見 https://perldoc.perl.org/5.30.0/perldelta.html
• 對(duì)現(xiàn)有MaterialsScript的更改信息，詳見Modified Perl requirements（新版本客戶端中的文件）。
Materials Studio基礎(chǔ)功能的改進(jìn)
• 在所有支持的平臺(tái)上，Materials Studio Gateway中部署的Apache版本已升級(jí)到2.4.46。
• Mozilla XPCOM軟件庫已經(jīng)從Materials Studio中移除。
BIOVIA License Pack的增強(qiáng)
License Pack現(xiàn)在使用FlexLM 11.16。許可證服務(wù)器中的License Pack必須是局域網(wǎng)中的最高版本。確保將License Pack更新到此版本，以保證客戶端許可證的核驗(yàn)。
BIOVIA License Pack的Linux安裝位置相比2018年及之前版本有所改變，現(xiàn)默認(rèn)位置為BIOVIA_LicensePack文件夾。
在Linux上安裝License Pack 7.6.14或更早版本的BIOVIA License Pack將不再執(zhí)行先前版本的原位置升級(jí)。如果需要繼續(xù)使用以前的許可證，則需要執(zhí)行一些附加的安裝步驟。有關(guān)詳細(xì)信息，請(qǐng)參閱新版本中 License Pack Online Help。
教程
新添加了以下教程：
• Calculating the Minimum Energy Path of a molecular switch：介紹了FlexTS結(jié)合DMol3和DFTB+來計(jì)算和細(xì)化一個(gè)多步的反應(yīng)路徑。
• PhaseField simulation of grain growth using Pipeline Pilot：演示如何在Materials Studio運(yùn)行Pipeline Pilot的Materials Studio Collection中的Grain Growth（PhaseField）protocol-晶粒生長protocols。
• PhaseField simulation of solidification using Pipeline Pilot：演示如何在Pipeline Pilot的Materials Studio Collection中運(yùn)行Solidification（PhaseField）protocol-硬化協(xié)議。
下列教程已更新為使用COMPASSIII力場：
• Adsorption Locator：
(1)基于Adsorption Locator確定SO2在Ni(111)表面的吸附位置
(2)模擬抑制劑在顏料紅晶體表面上的吸附
• CCDC：在Materials Studio中使用CSD
• Forcite：限制或非限制對(duì)稱約束條件下尿素的幾何優(yōu)化
• Forcite Plus：
(1)運(yùn)行受限剪切模擬
(2)計(jì)算丙酸在正辛醇中的溶劑化自由能
(3)搜索表面上分子的低能構(gòu)型
(4)聚合物與金屬氧化物表面的相互作用
• Morphology：
(1)顏料紅的形態(tài)預(yù)測
(2)使用Crystal Graph預(yù)測形態(tài)
• QSAR：設(shè)計(jì)新的緩蝕劑
• Reflex：基于能量的精修
• Reflex Plus：
(1)Structure solution in the presence of preferred orientation and energetic considerations in structure refinement
(2)Structure solution of 3-chloro-trans-cinnamic acid with Reflex Plus
• Scripting：
使用腳本計(jì)算兩層之間的相互作用能
• Sorption：
吸附法預(yù)測沸石MFI中CH4的吸附
同時(shí)更新以下教程：
• Calculating barriers of simple chemical reactions using DMol3's LST/QST and NEB tools: The title of the tutorial has been updated, it was previously "Exploring the minimum energy path of chemical reactions using DMol3's LST/QST and NEB tools".
為幫助運(yùn)行以下Pipeline Pilot Connector教程而提供的示例文件也已更新：
(1) Cross-linking polymers using Pipeline Pilot
(2) Calculating the stress-strain diagram using Pipeline Pilot
(3) Calculating the glass transition temperature using Pipeline Pilot
平臺(tái)支持
有關(guān)Materials Studio系統(tǒng)要求的完整詳細(xì)信息，請(qǐng)參見System Requirements and Recommendations（新版本客戶端中文件）。
支持平臺(tái)添加
服務(wù)器端增加了對(duì)以下配置的支持：
• Red Hat Enterprise Linux 8.1與8.2
• CentOS 8.1與8.2
排隊(duì)系統(tǒng)新增以下支持：
• Slurm Workload Manager 20.02.x
為64位Linux和Windows端添加了單GPU計(jì)算支持：
CUDA版本10.1、Compute Capability 6.0或更高的NVIDIA卡
刪除平臺(tái)支持
服務(wù)器端停止支持：
• Windows Server 2012 R2
排隊(duì)系統(tǒng)停止支持：
• Slurm Workload Manager 18
瀏覽器停止支持：
• Internet Explorer 11
Materials,Studio
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