Charmm

CHARMM是一個廣泛應(yīng)用于多粒子系統(tǒng)的分子模擬程序，具有一套全面的能量函數(shù)，各種增強的采樣方法，并支持多尺度技術(shù)，包括QM/MM，MM/CG，和一系列的隱式溶劑模型。在生物系統(tǒng)，包括多肽，蛋白質(zhì)，假體，小分子配體，核酸，脂類和碳水化合物，以及無機材料設(shè)計方面有廣泛的應(yīng)用。

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Charmm—多粒子系統(tǒng)的分子模擬程序

CHARMM是一個廣泛應(yīng)用于多粒子系統(tǒng)的分子模擬程序，具有一套全面的能量函數(shù)，各種增強的采樣方法，并支持多尺度技術(shù)，包括QM/MM，MM/CG，和一系列的隱式溶劑模型。在生物系統(tǒng)，包括多肽，蛋白質(zhì)，假體，小分子配體，核酸，脂類和碳水化合物，以及無機材料設(shè)計方面有廣泛的應(yīng)用。

主要功能：

● 支持基本的分子動力學計算，包括多種系綜、周期性邊界條件、多時間步長、簡正模分析、能量最小化等基本算法。

● 支持TIP3P、TIP4P、SPC、SPC/E及ST2等水分子模型。

● 支持多種高級算法，包括多種增強采樣方法，復(fù)雜的reaction coordinate restraints, 路徑采樣（path sampling）, 蒙特卡洛采樣（Monte Carlo sampling），路徑優(yōu)化算法及多種分析工具。

● 可處理經(jīng)驗化得能量計算，包括：相互作用能及構(gòu)象能量、局域最小化、旋轉(zhuǎn)勢壘、與時間相關(guān)的動力學行為、振動頻率等。

● 擁有三個可極化力場相關(guān)模塊，支持隱式溶劑模型

● 支持量子力學與經(jīng)典力學混合的QM/MM計算。
關(guān)鍵詞:
- Charmm
- 分子模擬