COSMOlogic 2023新功能！
BIOVIA COSMOtherm 2023是預(yù)測(cè)流體性質(zhì)的通用工具。
關(guān)鍵技術(shù)要點(diǎn)：
• BIOVIA COSMOtherm 2023是預(yù)測(cè)流體性質(zhì)的通用工具。
• BIOVIA COSMOtherm 2023包括附加模塊COSMOplex和COSMOperm，通過(guò)license文件激活，license文件條目為BIOVIA COSMOplex&perm。
• BIOVIA COSMOtherm 2023作為BIOVIA Pipeline Pilot附加模塊包含在Pipeline Pilot Solvation Chemistry Collection中，允許在BIOVIA Pipeline Pilot中進(jìn)行COSMOtherm計(jì)算。Pipeline Pilot Solvation Chemistry Collection是一個(gè)單獨(dú)的安裝程序包，安裝于BIOVIA Pipeline Pilot服務(wù)器端。請(qǐng)注意，BIOVIA Academic COSMO Suite中不包含Pipeline Pilot Solvation Chemistry Collection。
新功能：
◆ 在Pipeline Pilot中作為Pipeline Pilot Solvation Chemistry一部分使用BIOVIA COSMOtherm,增強(qiáng)了BIOVIA COSMOtherm在晶習(xí)（晶體形貌）研究中溶劑影響預(yù)測(cè)及溶劑篩選能力。
◆ 預(yù)測(cè)電解質(zhì)系統(tǒng)的熱力學(xué)性質(zhì):新版本提供了針對(duì)電解質(zhì)系統(tǒng)的特殊參數(shù)集COSMO-RS-ELYTE/COSMO-RS-ELYTE參數(shù)集更好地預(yù)測(cè)質(zhì)子溶劑類的電解質(zhì)系統(tǒng)性質(zhì)，包括硬核小離子(如堿金屬原子離子)。
◆ 預(yù)測(cè)更高質(zhì)量的固體溶解度：基于新型隨機(jī)森林/梯度增強(qiáng)機(jī)器學(xué)習(xí)模型(Random-Forest/Gradient Boosting)，BIOVIA COSMOtherm 2023的所有計(jì)算精度級(jí)別(level)支持熔點(diǎn)(Tmelt)和融合焓(Hfus)性質(zhì)預(yù)測(cè)。COSMOtherm 2023的命令行和UI作業(yè)中實(shí)時(shí)預(yù)測(cè)溫度相關(guān)熔融吉布斯自由能(Gfus(T))。
◆ 在命令行COSMOtherm和UI COSMOthermX中計(jì)算溫度相關(guān)的傳輸特性：擴(kuò)散系數(shù)、液體導(dǎo)熱系數(shù)和粘度。
增強(qiáng)功能：
(1) 在COSMOthermX中，增加了用于傳輸特性計(jì)算面板塊：液體導(dǎo)熱系數(shù)（LTC選項(xiàng)）和擴(kuò)散系數(shù)（DIFFCOEFF選項(xiàng))。修訂了粘度計(jì)算面板（Viscosity選項(xiàng)）中COSMOtherm 2019版中引入的粘度QSPR模型。在COSMOthermX UI“化合物屬性”和COSMObase和COSMObaseEditor中啟用了LTC計(jì)算中使用的實(shí)驗(yàn)純化合物粘度的輸入。
(2) 在COSMOthermX圖形用戶界面中啟用了溫度相關(guān)密度預(yù)測(cè)模型QSPR參數(shù)的輸入功能。
(3) COSMOthermX中增加了混合物密度預(yù)測(cè)功能模塊。
(4) 在COSMOtherm命令行求解器中，在所有屬性計(jì)算中啟用了體積分?jǐn)?shù)單位濃度的輸入和輸出。表文件中的體積分?jǐn)?shù)輸出由新關(guān)鍵字pr_phi觸發(fā)，使用關(guān)鍵字phi輸入體積分?jǐn)?shù)。體積分?jǐn)?shù)由給定溫度下化合物的液體摩爾體積計(jì)算。如果有可用的實(shí)驗(yàn)密度數(shù)據(jù)，則用實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)；如果沒(méi)有可用實(shí)驗(yàn)密度數(shù)據(jù)，COSMOtherm將使用密度預(yù)測(cè)QSPR模型預(yù)測(cè)液體摩爾體積。
(5) COSMOthermX中的三相LLE相圖進(jìn)行了重構(gòu)和增強(qiáng)。
(6) 增強(qiáng)型COSMOmic和COSMOperm 3D Viewer可以顯示不同膠束或膜深度中完整構(gòu)象集的方向。早期版本中，只提供了第一個(gè)conformer的方向，這不一定是正確的解決方案。
(7) COSMO-RS狀態(tài)方程(EOS)擴(kuò)展功能在COSMOthermX GUI中應(yīng)用到可壓縮液體和真實(shí)氣體系統(tǒng)，直至臨界點(diǎn)的以下屬性：密度ρ(T，x)(密度選項(xiàng))、蒸汽壓pvap(T,x)(pvap選項(xiàng))、亨利常數(shù)和溶劑化自由能(Henry/GSOLV選項(xiàng))、二元相圖計(jì)算(汽液/液液/固液(BINARY/LLE/SLE選項(xiàng)）)。
(8) 圖形用戶界面COSMOthermX、COSMOquick、COSMOconfX和TMoleX中使用的Java“Look and Feel”Synthetica已更新到V3版本。
(9) 增強(qiáng)了sigma矩和原子sigma矩的文件輸出和表輸出的可用性。使用LONGTAB選項(xiàng)可以獲得長(zhǎng)數(shù)字格式的.mom和.moma文件。
(10) 考慮液相和氣相中Grimme D3色散能的貢獻(xiàn)，增強(qiáng)了混合物性質(zhì)計(jì)算功能，關(guān)鍵字組合CTAB WCONF。如果可以從cosmo或能量文件中獲得，或者如果當(dāng)前使用了BPTZVPD-FINE級(jí)別參數(shù)，則將色散能量輸出到CTAB WCONF表輸出的conformer屬性子表中的其他列。
(11) COSMOtherm命令行求解器中啟用了離子的共晶篩選選項(xiàng)。COCRYSTAL和IGNORE_CHARGE關(guān)鍵字的組合允許計(jì)算帶電物種的共晶體描述符。由于所實(shí)現(xiàn)的COCRYSTAL描述符不適用于離子，如果它與離子API或配體一起使用，將觸發(fā)額外的警告消息。
(12) COSMOthermX的混合物面板中增加了“Add All Pure”功能鍵，該功能允許一鍵輸入所有純化合物的簡(jiǎn)單混合物計(jì)算作業(yè)列表。
(13) COSMOthermX UI中的二元固液平衡(binary SLE)相圖計(jì)算的圖形繪圖功能，如果系統(tǒng)中存在共晶點(diǎn)，則會(huì)自動(dòng)對(duì)共晶點(diǎn)進(jìn)行輸出。此信息以前僅寫入U(xiǎn)I圖形窗口，但現(xiàn)在也可以導(dǎo)出到Excel。
(14) COSMOthermX中的“ New Molecule ”工作流不允許在作業(yè)仍在運(yùn)行時(shí)提取數(shù)據(jù)。一個(gè)新的消息框“ 請(qǐng)注意，只有已完成的作業(yè)才能添加到數(shù)據(jù)庫(kù)或化合物列表中 ”使這種行為更加明確，如果用戶試圖將正在運(yùn)行的作業(yè)中的分子添加到數(shù)據(jù)庫(kù)中，則會(huì)出現(xiàn)該消息框。
(15) MCOS文件(MCSE)的一致性加權(quán)選項(xiàng)現(xiàn)在可以與外部量子化學(xué)能量輸入(UQMG)選項(xiàng)的一致性權(quán)重相結(jié)合。
(16) Solvation Chemistry Pipeline Pilot Collection中COSMOtherm混合物組分定義用戶體驗(yàn)進(jìn)一步增強(qiáng)?，F(xiàn)在，作為“Property Options”中階段定義的基于文本的$PHASE輸入的替代，可以為phase定義參數(shù)設(shè)置。在這種情況下，自動(dòng)設(shè)置phase定義關(guān)鍵字，進(jìn)一步簡(jiǎn)化了COSMOtherm的phase篩選作業(yè)的輸入。
(17) 作為Pipeline Pilot中形態(tài)學(xué)溶劑篩選工作流程的一部分，Pipeline Pilot Solvation Chemistry Collection添加了一個(gè)協(xié)議(protocol)，該協(xié)議使用COSMOtherm計(jì)算給定一組晶體表面和一組溶劑的活性系數(shù)。
(18) 作為Pipeline Pilot中形態(tài)學(xué)溶劑篩選工作流程的一部分，Pipeline Pilot Solvation Chemistry Collection添加了兩個(gè)協(xié)議(protocol)，分別計(jì)算給定晶體結(jié)構(gòu)的形態(tài)學(xué)，以及應(yīng)用Pipeline Pilot Materials Studio Collection中DMol3協(xié)議(protocol)和Growth Morphology計(jì)算周期性晶體表面COSMO文件。
(19) 作為Pipeline Pilot中形態(tài)學(xué)溶劑篩選工作流程的一部分，在Pipeline Pilot Solvation Chemistry Collection添加了一個(gè)協(xié)議(protocol)，該協(xié)議使用層次聚類法(Hierarchical Clustering)分析給定溶劑組中的晶體表面活度系數(shù)。
COSMOlogic,2023
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